结构组成不同、功能作用不同等区别。

1、结构组成不同：小鼠的血脑屏障由软脑膜、毛细血管壁和神经胶质细胞形成的胶质膜构成，人类的血脑屏障由毛细血管壁和神经胶质细胞形成的两个层面组合而成。

2、功能作用不同：小鼠的血脑屏障主要起到阻挡病原微生物、毒性产物以及染料颗粒等外部有害物进入大脑，起到保护中枢神经系统免受损害；人类的行过程中对特定物系统具有重要影响。