工程税收的计算方法是根据工程所得额来计算的。工程所得额指工程款项扣除合同约定和法定的直接可变成本后的余额。工程税收的税率一般为9%，计算方法如下：

税收金额 = 工程所得额 × 9%

例如，如果工程所得额为100,000元，则税收金额为100,000 × 9% = 9,000元。

需要注意的是，税法可能随时有修改，具体的税率和计算方法可能因地区和法规而异。因此，在具体操作中，建议您查询当地的税法规定，或者咨询相关专业人士以获取准确的信息。