补办流程：联系为你公司做体系认证的认证中心，向其说明情况。有的认证中心可能要求你提交书面申请，说明证书遗失原因，让你交一定工本费和人工费用。就可以给你补发了。

但是我个人认为，证书遗失，如果不是特别需要，没有必要补办。因为一般质量管理体系认证一年会做一次复查，三年有效期。所以等复查的时候，让认证中心给你重新颁发一张就OK了。至于中途要用，可以去认证中心官网查询，比如客户要求你提供，你跟客户说明真实情况，然后查询你公司认证情况给他看，或展示认证中心对你公司复查时审核报告给他看，一般人都会理解的吧。