当企业获得专为特定用途设计的财政拨款时，应当通过"专项应付款"科目进行会计处理。这个科目用于记录政府作为出资人投入的企业专项或特定用途的资金。专项应付款科目可以根据资本性投资项目进行详细记录。在实际操作中，企业收到拨款时，会计分录为借记"银行存款"，贷记"专项应付款-科研经费"。

当科研项目完成后，如果需要核销的部分，需要经过审批后，借记"专项应付款-科研经费"，贷记相应的费用或成本科目。对于拨款结余，如果需要退还，借记"专项应付款-科研经费"，贷记"银行存款"。如果结余不需退还，这部分资金则会转为企业的资本公积，借记"专项应付款-科研经费"，贷记"资本公积"。

专项应付款科目期末如果表现为贷方余额，意味着企业还有尚未转销的专项应付款。这个科目余额反映了企业对政府专项拨款的管理和使用情况。在财务报表中，这些处理方法有助于清晰地展现企业的财务状况和资金流向。