办理日本留学签证的流程包含几个关键步骤，具体如下：

首先，如果已有护照，这一环节可以省略。接着，向你所录取的日本大学的招生办公室或相关事务部门提交办理在留资格认定证明书所需的所有资料。通常，在提交资料后，大学会寄送在留资格认定证明书给你。

随后，准备好所有用于签证申请的材料。这些材料通常包括但不限于在留资格认定证明书、护照、录取通知书、财务证明等。

然后，携带上述所有材料，前往日本国在华的大使馆或总领事馆指定的签证申请服务中心办理签证手续。请注意，此过程可能需要一周左右的时间，因为签证申请材料的审查通常需要4个工作日。此外，由于服务中心需要一定时间处理，所以预计整个流程可能需要一周左右。

最后一步，一周后，凭服务中心的收据，前往该服务中心领取护照。请注意，签证申请流程中，根据具体情况，审查时间可能会有所延长。

总的来说，日本留学签证办理流程分为提交资料、准备申请材料、在使馆或领事馆办理签证和领取护照四个主要步骤。整个流程的完成时间约为两周左右，需要提前准备，以免影响行程。