原始档案在人才中心存档时，应通过公对公方式转递自考档案至人才中心，再办理档案合并存档手续。如单位具备档案保管权限，可将自考档案与人事档案合并存于单位。若原始档案持有个人手中，需激活档案后办理合并。在私企就业者，可将自考档案与原始档案存入工作地人才中心；无单位或在私企者，也可存入人才中心。若原始档案位置不明，可从毕业学校或原户籍地档案管理部门寻找，找到后办理合并存档手续。无法找到原始档案时，申请补办，补齐材料后办理合并存档。

自考毕业档案保存在个人手中，可能导致档案成为死档，影响使用及解决难度。保存不当可能导致信息暴露、重要材料丢失，增加补办材料的麻烦。正确存放档案，确保安全与便捷使用，尤其对职场人士尤为重要。建议根据自身就业情况，将档案妥善存于工作单位或人才市场。