整理原始凭证需分门别类，首先，将收入发票与成本发票区分开来。成本发票再细分专票与普票，专票可抵扣，普票则不可，方便后续账务处理。

接着，整理银行单据。按照对账单顺序排列，避免漏单，无论是先做收款后付款还是先付款后收款，均能防止银行账户出现赤字，这是必须遵守的原则。涉及银行收付与发票时，应将相关单据与发票一同整理，避免重复记账。

费用发票整理亦需仔细分类，依据公司设置，通常分为管理费用、差旅费、业务招待费、餐费、办公费、交通费、加油费、服务费等，或根据企业需求增设科目。同一类别的等额费用发票应贴在一起，便于计算。贴好后，附上费用报销单，整理完毕，即可开始进行账务处理。