深圳户籍与非户籍在待遇上有显著差异：

在补贴方面，深户居民能享有更高的福利，本科毕业生可领取15000元补贴，硕士研究生补贴25000元，博士研究生补贴30000元，而非户籍居民则无此福利。

房产权益上，深户居民具有直接购房的资格，而非深户居民则需连续缴纳5年社保方能具备购房资格。

对于儿童教育，深户居民的孩子在积分入户方面享有最大加分，提高了入读公立小学的机会，而非深户孩子则无法享受这一优势，入读公立小学的可能性较小。

在社保福利上，深户居民的养老保险待遇更高，享有医保一档的福利，享有更高的报销比例和更广的使用范围，且能个人自行缴纳社保。而非深户居民的养老保险待遇较低，医保报销比例也相对较低，社保只能通过公司缴纳。

在医疗保障方面，深圳户籍的新生儿一出生就能办理少儿医保，而非深圳户籍儿童则需在入园或入学时才能申请办理。