深圳杯数学建模比赛会进行查重。

根据深圳杯数学建模比赛的规定，所有参赛作品都会进行查重。比赛组委会会使用专业的查重软件对参赛作品进行检测，以确保作品的原创性和学术诚信。如果发现作品存在抄袭或剽窃行为，将会被取消参赛资格或扣除相应的分数。因此，深圳杯数学建模比赛会进行查重。