病毒作为专性寄生生物，根据其寄主的不同，通常分为植物病毒、动物病毒以及细菌病毒（噬菌体）。其分类体系基于复杂的生物特性和遗传特性，包括病毒粒子的形态特征、基因组结构、蛋白质特性、复制机制、抗原性质以及生态特性等。病毒的分类等级包括目、科、亚科、属和种，其中目和科是主要分类阶元，当没有明确目的时，科作为最高级别。种则是由具有相似复制谱系、特定生境和共同特征的病毒组成，新种在未确定分类地位时可作为暂定种。

国际病毒分类委员会（ICTV）在2005年的第八次报告中，详细列出了3个目、73个科、289个属以及2000多种病毒。植物病毒方面，分类尤为细致，被划分为18个科和81个属，其中17个属尚未有科级别的分类。报告中收录了1569种植物病毒，其中确定种有763种，暂定种279种。科、属的名称采用缩写和斜体字母表示，而种的名称则沿用英文俗名格式，首字母大写，通常由寄主名称、症状和"virus"组成。