一是将代征个人所得税手续费计入“往来款项”科目。

二是将代征个人所得税手续费计入“其他业务收入”科目。

三是将代征个人所得税手续费计入“营业外收入”科目。

根据《财政部国家税务总局中国人民银行关于进一步加强代扣代收代征税款手续费管理的通知》（财行[2005]365号），三代单位所取得的手续费收入应单独核算，计入本单位收入，用于三代管理支出，也可以适当奖励相关工作人员。

根据《个人所得税代扣代缴暂行办法》（国税发[1995]065号）规定，对扣缴义务人按照所扣缴的税款，付给2%的手续费。扣缴义务人可将其用于代扣代缴费用开支和奖励代扣代缴工作做得较好的办税人员。

对于企业取得代扣个人所得税代手续费返还，从用途上讲应该有两种，一种是用于代扣代缴工作的管理性支出，另一种是用于奖励有关工作人员。

根据《财政部国家税务总局关于个人所得税若干政策问题的通知》（财税字[1994]20号），个人办理代扣代缴税款手续，按规定取得的扣缴手续费，暂免征收个人所得税。