函授大专与自考本科在报考条件上存在差异，函授大专要求高中或同等学历，而函授本科则需大专或同等学历。自考则对学员基本没有学历要求，但申请自考本科毕业前需提供大专学历证明。

在本科毕业证书方面，函授本科证书上会注明成人高考字样，并盖有录取学校的印章。而自考本科证书则需带有自学字样，并盖有主办院校和当地自学委的双章。

函授大专与自考本科在定义上也有所区别。函授是成人高等学校招生全国统一考试，考生通过全国统一入学考试被录取后开始学习，完成学业要求即可毕业。自考则是个人自学与国家考试相结合的教育形式，学员选择专业课程后参加国家统一考试，全部科目及格即可毕业。