部队考军校，本科和专科的区别主要体现在毕业后的待遇上。参照军校毕业待遇规定，专科毕业生首次定职定级确定为正排职，授予少尉军衔；本科毕业生则首次定职定级确定为副连职，授予中尉军衔。技术专业的本科毕业生首次定职定级确定为专业技术13级，授予专业技术中尉军衔。此外，国防生毕业后，在首次定职定级、住房分配、医疗保障等方面，与同期入军事院校学习的本科毕业学员享有同等对待。

本科和专科军校毕业生的待遇差异，直接体现在军衔和职级的评定上。本科毕业生因为学历较高，获得的初始职级和军衔通常会更高，这对于军队内部的晋升和发展路径有着直接的影响。相比之下，专科毕业生的初始职级和军衔较低，但也有着自己的优势和发展空间。

除了职级和军衔的差异，本科和专科毕业生在其他方面的待遇也有所不同。例如，在住房分配和医疗保障方面，国防生和本科毕业生享有同等的待遇，这为他们的职业发展和生活提供了更好的保障。专科毕业生在这些方面虽然可能与本科毕业生有所不同，但军队也会尽力提供合理的待遇和支持。

综上所述，部队考军校的本科和专科的区别主要体现在毕业后的待遇上，包括职级、军衔的评定以及在住房分配、医疗保障等方面的待遇。军队为不同的学历层次的毕业生提供了不同的待遇和保障，以鼓励更多优秀人才投身军队建设，实现个人与国家的共同发展。