执业助理医师与执业医师在岗位聘任、报考条件、考试范围、执业级别和技术薪级方面存在显著区别。取得执业助理医师资格后，可获聘医士职务；而取得执业医师资格，则可获聘医师职务。

在报考条件上，执业医师资格需具备高等医学院本科及以上学历，且需在执业医师指导下，在医疗机构中试用或实习满一年。而中专或大专学历者，需先考取执业助理医师资格，大专学历需从业2年，中专学历需5年，才能报考执业医师。

考试方面，医师资格考试分为执业助理医师和执业医师两个等级，均包括实践技能考试和医学理论考试。执业助理医师考试难度相对较低，大纲掌握范围较小。

在执业级别上，执业助理医师注册后限于乡镇一级卫生院或村级卫生所执业，其他等级机构需在执业医师指导下执业。而执业医师在全国内地各个医疗机构注册后，可取得合法执业资格，并拥有处方权。

技术薪级上，执业助理医师与执业医师的经济报酬存在差异。《执业医师法解释》指出，执业助理医师不能在二级以上医疗机构单独执业，即一级为乡镇医疗机构，二级为县区医疗机构，三级为市级以上医疗机构。执业助理医师能在乡镇医疗机构独立从事一些简单的医疗操作，而要取得三级范围内的单独行医执业资格，则需考取执业医师资格，才能注册行医。

在执业要求上，执业助理医师需在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中按照其执业类别执业。在乡、民族乡、镇的医疗、预防、保健机构工作的执业助理医师，根据医疗诊治情况和需要，可独立从事一般的执业活动。