微生物对宿主的定植有很强的特异性，那个部位能定植那种微生物是一定的。例如，表皮葡萄球菌在皮肤，甲型链球菌在咽部，唾液链球菌在唾液和舌面部，大肠杆菌在结肠粘膜等，这些都是特异性的。这些微生物和宿主的“特殊关系”，是在长期的历史过程中形成的，是由共同的遗传性机制决定。

细菌定植过程极为复杂，它决定于细菌本身的粘附能力、宿主的粘附受体、细菌的数量、粘附部分的温度和酸度等。因此，不是所有的细菌都可以定植的，但是一般地说原藉菌较易定植，外籍菌不易定植。