奥·巴图巴雅尔的职业生涯始于1990年8月，当时他在巴音郭楞蒙古自治州政府办公室担任科员。

随后在1997年7月，他晋升为州政府办公室的翻译，职位级别为中级。在积累了丰富的经验后，他在2002年4月进一步担任办公室副主任科员。

2004年3月，他的职务进一步提升，成为副译审（副高）并同时担任办公室主任科员，显示了他在翻译和管理方面的卓越能力。

2006年2月，他加入了州机关事务管理局，担任党委委员并兼任纪检委书记，职责范围扩大，管理职责也更加重要。

2008年3月，他的职业生涯又向前迈进了一步，成为州人大常委会办公室的副主任，这表明他在公共服务领域获得了新的认可。

到了2010年9月，奥·巴图巴雅尔的职务进一步提升，成为焉耆县委常委，显示他在地方政治领导层的角色日益凸显。