金陵科技学院2005年由农业专科学校和职工大学合并而成，学科实力较弱，比较好的学科主要在工商管理、设计学、城乡规划学三个省一级重点建设学科。常州工学院2005年由常州工业技术学院、常州市机械冶金职工大学合并组建而成，工科实力较强，最好的学科是机械工程和软件工程。总体而言，常州工学院要好于金陵科技学院，特别是在工科领域。