泗水县国家税务局设有多个内设机构，它们各自承担不同的职能。其中，办公室主要负责起草和审核重要文件，处理机关事务，进行税收宣传，以及网站运行和维护等工作。它还负责组织人大代表议案、建议和政协委员提案的处理，以及税收科研和学术交流的组织工作。

政策法规科负责制定和执行依法行政、依法治税方案，协调多税种政策落实，并进行合法性审核。此外，科里还负责重大税收案件审理、税务行政审批、行政复议等工作，以及进出口贸易税收管理的实施办法制定和监督。

税政科负责企业所得税、储蓄存款利息所得税等的征收管理工作，进行纳税评估和税源管理。同时，还指导税种的日常管理、检查，以及非居民企业所得税和国际税务事务的协调处理。

收入核算科负责年度税收计划的编制和税款监控，进行税收收入分析和重点税源监控。科里负责税收会计核算和数据管理，发布税收收入数据。

纳税服务科负责税务系统的纳税服务协调，包括纳税服务规范、税法宣传，以及办理各类涉税事项。此外，还负责车辆购置税的管理工作。

征收管理科负责综合性税收征管法规的实施，研究优化征收管理规程，负责税务登记、发票管理和风险管理工作。

人事教育科负责人事管理，包括机构编制、考核、教育培训，以及离退休干部的管理和服务。

监察室负责纪律检查、行政监察工作，受理违规案件查处，组织党风廉政建设和反腐败工作。

税源管理科负责税源监控和纳税户管理，包括税源分析、纳税辅导、日常检查等工作，但根据需要，暂时不设。

最后，机关党委办公室负责机关的党群工作，包括精神文明建设、政治业务学习和人员思想政治工作等。