FAD和FMN。黄素酶或黄素蛋白的种类很多如琥珀酸脱氢酶、脂酰CoA脱氢酶等，其辅基只有两种：FAD（黄素腺嘌呤二核苷酸）、FMN（黄素单核苷酸），两者均含核黄素（维生素B2）。