医院收入需要缴纳的主要税种是营业税和所得税。

一、营业税

医院作为一种服务行业，其提供的医疗服务收入需要缴纳营业税。根据国家的税收法规，医院的服务收入属于应税服务，需要按照规定的税率缴纳营业税。具体的税率可能会根据服务类型有所不同。

二、所得税

除了营业税，医院的盈利收入还需要缴纳所得税。所得税是针对企业或个人的净利润进行征收的，医院在运营过程中，如果有盈利，就需要按照相应的税率缴纳所得税。

详细解释：

营业税：

营业税是针对服务提供的税收，医院提供的医疗服务属于应税服务。营业税的税率通常由国家规定，并可能根据服务的不同类型有所区别。例如，药品销售、诊疗服务等都可能被列为应税服务，并需要按照相应的税率缴纳营业税。

所得税：

所得税是对企业或个人的净利润进行征收的一种税。医院的运营过程中，如果有盈利，就需要根据盈利的金额和相应的税率来缴纳所得税。所得税的税率通常由国家的税法规定，并根据医院的经营情况和规模来确定具体的税额。

总的来说，医院在运营过程中需要按照国家的税收法规，对其服务收入和盈利收入进行纳税。具体的税种和税率可能会根据国家的政策和法规有所调整，因此医院需要密切关注相关税收政策的变化，以确保合规经营。