军事设施建设助理员主要负责协助军事设施建设项目的规划、设计、施工和管理工作。

他们的工作内容包括：

1. 参与军事设施建设的规划工作，包括制定建设方案、设计图纸、施工计划等；

2. 协助相关部门进行工程建设项目的审批和报备工作；

3. 监督施工进度和质量，确保工程建设符合军事要求和标准；

4. 协助处理工程建设过程中的突发事件和安全事故，并及时向上级报告；

5. 参与工程建设项目的验收工作，确保工程建设符合预期标准。

具体工作内容可能会因不同的军事设施建设助理员和不同的项目而有所不同。此外，他们还需要具备一定的军事知识和技能，以便更好地完成工作。