证书年审计的会计科目是管理费用。

详细解释如下：

一、证书年审计的概念

证书年审计是针对企业或其他组织所获得的证书进行的年度审核活动，以确保其持续符合相关标准或规定。这些证书可能涉及企业的运营资质、产品质量、安全认证等。为了完成这一审计，企业通常需要支付一定的费用。

二、会计科目的选择

管理费用是指企业为管理和组织经营活动而发生的各项费用。证书年审计作为企业运营中的一项必要活动，其产生的费用应当归属于管理费用类别。具体而言，企业在记账时，可以将证书年审计的费用归入到管理费用的相关子科目中。

三、会计科目的重要性

正确地将证书年审计的费用记入相应的会计科目，有助于企业准确反映其运营成本，为管理者提供有关费用控制的准确信息。此外，这也有助于企业遵守相关的财务法规和准则，确保其财务信息的真实性和透明度。通过合理的费用分配和管理，企业可以更好地优化资源配置，提高运营效率。

总之，证书年审计的费用应记入企业的管理费用科目。企业在记账时，应确保其财务操作的合规性，并准确反映真实的运营情况。