如果转账两万元但款项未到账，会计处理上应当反映这一未达账项。根据会计原则，企业应当在账面上记录所有已发生的交易，包括那些尚未在银行账户上体现的交易。以下是处理这种情况的会计分录：

记录转账时的会计分录：

借：银行存款在途

贷：银行存款

这个分录反映了您从银行账户转出的款项，但由于款项还在途中，因此借记了一个“在途”账户。

款项到账时的会计分录：

借：银行存款

贷：银行存款在途

当款项实际到达对方账户时，您需要做上述分录来冲销“在途”账户的余额。

注意，具体的会计分录可能需要根据您公司的会计政策和实际情况进行调整。如果款项长时间未到账，可能需要进一步的会计处理，例如设置“未达账项”科目，并在月末与银行进行对账。