内务府衙门分内务府堂及所属七司、三院等50多个部门，总称总管内务府衙门，其最高官员为总管内务府大臣，特任，无定额。内务府总管为内务府之主官，品等为正二品，通常为宦官担任，下设如会计等七个司，功能职务为管理出纳，财务收支，祭祀礼仪等。

七司：

广储司（下设六库、七作、二房）

六库：银库、皮库、瓷库、缎库、衣库、茶库

七作：银作、铜作、染作、衣作、绣作、花作、皮作

二房：帽房、针线房

都虞司（下设东档房、西档房等办事机构）

掌仪司（下设果房、神房、中和乐处、僧录司、道录司、东档房、西档房、本房等办事机构）

会计司

营造司（下设七库、三作）

七库：木库、铁库、房库、器库、薪库、炭库、圆明园薪炭库

三作：铁作、漆作、花炮作

庆丰司

慎刑司

三院：

上驷院

武备院：下设北鞍库、南鞍库、甲库、毡库

奉宸苑

内务府属其他机构：

三织造处：江宁织造、苏州织造、杭州织造

织染局

绮华馆

打牲乌拉处

内三旗参领处及包衣各营

内三旗参领处

内三旗包衣营

其他

养鹰鹞处及内外养狗处

御茶膳房

雍和宫

中正殿

升平署

陵寝官（盛京陵寝事务总管大臣、东陵总管大臣、西陵总管大臣）

内三旗银两庄头处

内管领处（掌关防处）：下设内饽饽房、外饽饽房、酒醋房、菜库、器皿库、车库、管理苏拉车辆处

官三仓

恩丰仓 官房租库

总理工程处

张家口外群牧处

牺牲所

管辖番役处

御鸟枪处和内火药库

圆明园

畅春园

清漪园

静明园

静宜园

御船处

热河行宫

汤泉行宫

盘山行宫

黄新庄行宫

三大殿（太和殿、中和殿、保和殿）

宁寿宫

管理慈宁宫、寿康宫处，慈宁宫花园处

御药房

文渊阁

武英殿修书处

御书处

养心殿造办处

咸安宫官学

蒙古官学

景山官学

长房官学

办理回人事务佐领处及回缅官学

回子官学

敬事房

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