联合培养硕士研究生毕业后的学历证书是相同的。

首先，我们需要明确联合培养硕士研究生的含义。联合培养通常指的是两个或多个高等教育机构之间合作，共同负责研究生的培养工作。这种合作模式可以使学生接触到更广泛的学术资源和研究环境，有助于提升研究生的学术水平和研究能力。然而，不论是由单一机构培养还是联合培养，硕士研究生的学历证书都是由国家教育部门统一印制和认证的。

其次，学历证书是对学生完成学业的官方证明，其格式和内容都有严格的规定。在中国，硕士研究生的学历证书由国家教育部监制，各高等教育机构按照统一的模板进行印制。证书上通常会注明学生的姓名、性别、出生日期、专业名称、学制、毕业时间等基本信息，以及学校的名称、校长的签名和学校的印章。这些信息是标准化的，不会因为学生是联合培养的还是单一机构培养的而有所差异。

最后，从实际操作的角度来看，联合培养硕士研究生的学历证书在就业、升学等方面与单一机构培养的硕士研究生学历证书具有同等的法律效力。用人单位或招生单位在审查学历时，关注的是学历证书的真实性和学生的学术背景，而不会去区分学生是通过联合培养还是单一机构培养获得的硕士学位。

综上所述，联合培养硕士研究生毕业后的学历证书与单一机构培养的硕士研究生的学历证书是相同的。这种统一性保证了学历证书的公正性和权威性，也为学生的未来发展提供了平等的竞争环境。