雅安地区拥有两所主要的高等教育机构：

第一所是四川农业大学，正式名称为“川农大”。这所大学由四川省政府主管，以生物科技和农业科技为特色，致力于多学科的均衡发展。它被列为国家“211工程”重点建设大学，同时参与了诸如“111计划”、“卓越农林人才教育培养计划”和“援疆学科建设计划”等国家级项目。四川农业大学还是“973计划”承担高校，以及四川省“四川2011计划”和全国首批新农村发展研究院试点单位。此外，学校具有自主招生资格，表明其在教育领域的显著地位。

第二所是雅安职业技术学院，成立于2002年，是一所由政府主办的全日制普通高等学校。学院的成立源于原雅安卫生学校与其他几所教育机构的合并。作为一所具有临床医学类和教育类专业招生资格的高职院校，雅安职业技术学院在医学影像专业上得到了香港华夏基金会的重点支持，护理专业则被列入国家紧缺技能型人才培养项目，显示了其在专业领域的优势。