历史渊源不同。

书院制起源于中国古代的儒家文化，早在汉代就已经存在，是中国独特的教育制度。而学院制则起源于欧洲中世纪的天主教教育体系，随着欧洲文艺复兴时期的到来而逐渐发展起来。

书院制和学院制虽然有着不同的发展历史和文化背景，但是它们都是人类教育发展的重要里程碑，对于现代教育体系的建设和发展也有着深远的影响。在当今社会，学院制已经成为了主流的教育制度，被广泛应用于各个领域和层次的教育，包括高中、大学、研究生院等。