山东潍坊科技学院设置14个二级学院，提供了63个本科与专科教育专业，其中包括5个山东省优势特色专业、10个一流专业建设点与8门一流课程。

工学领域涵盖13个专业：汽车服务工程、机械设计制造及其自动化、机械电子工程、车辆工程、电气工程及其自动化、电子信息科学与技术、计算机科学与技术、软件工程、物联网工程、土木工程、化学工程与工艺、环境工程、建筑学。

农学领域则包括园艺与植物保护两个专业。

艺术学领域设有一个动画专业。

管理学领域则提供了工程管理、工程造价、市场营销、财务管理、人力资源管理、酒店管理、物流管理、国际商务共8个专业。