自考大专与函授大专在学习形式上有显著区别，自考采取自学方式，而函授则在特定时间进行面对面授课。

在报考次数方面，自考每年提供两次考试机会，分别在4月份和10月份，而函授则每年仅一次，考试时间在10月份。

两者在招生对象上也有所不同，自考对报名者不设性别、年龄、民族、种族、宗教信仰、财产状况及教育程度的限制，只要是中国公民皆可报名参加。相反，函授要求考生具备高中文化程度。

在毕业证书方面，自考大专的毕业证书为成人高等教育自学考试毕业证书，而函授大专的毕业证书则为成人高考毕业证书。